Школа №46 пгт Черноморского МО Северский район приняла своих первых учеников  в 1951 году.

Школа является Победителем конкурса Приоритетного национального  проекта «Образование» в 2006 году,  внесена в Единый реестр лучших школ России в 1999 году.

42 года школой руководила Нипиющая Людмила Петровна. Людмила Нипиющая – вошла в реестр лучших директоров школ страны. Имеет звания Отличника народного образования, Заслуженного учителя России, за большой вклад в развитие системы  образования Северского района занесена на Доску Почета «Лучшие люди Северского района».

Школа ведет активную деятельность в Ассоциации образовательных организаций Северского района по духовно-нравственному воспитанию учащихся.

Бурьян Анна Николаевна, учитель музыки, является автором и исполнителем песен, входящих в репертуар многих музыкальных коллективов Краснодарского края: «Здесь России начало», «Адрес детства – родная Кубань!», «Северский район», «С днем рождения, Краснодарский край!», «Русь святая», «Живи, Кубань!», «Утро - Северский район».

Колонтаевская Вера Витальевна, учитель истории и обществознания в 2014 году провела цикл экскурсий по выставке «Православная Русь. Моя история. Романовы» в выставочном зале г.Краснодар.

Школа в 2010 году стала лауреатом конкурса-фестиваля «Весенняя фантазия», проводимом творческим объединением «Премьера».

Выпускник Александр Техтелев является ведущим солистом творческого объединения «Премьера» им. Л.Гатова, имеет звание «Заслуженный артист Кубани».   Выпускница школы Виктория Костогрыз являлась членом сборной команды Краснодарского края  по пляжному волейболу, кандидатом в сборную Российской Федерации по пляжному волейболу, стала чемпионкой России на Всероссийской 6 Летней Спартакиаде учащихся России.